从单基因突变到全基因组 :塑造精准肿瘤学诊断的分子技术
分子技术引领检测方案设计 | tNGS
基于杂交捕获的tNGS
基于扩增子的tNGS
Targeted NGS靶向测序 兼具广度与深度的分子诊断方案
tNGS 作为一种高度多重化的检测技术,填补了传统qPCR 单一靶点检测与全基因组测序之间的空白,在保持数据复 杂度可控的同时,实现了更大范围的突变检测能力。tNGS 检测面板通常覆盖 20 到 500 个基因位点,能够同时识别 多种突变类型,包括:单核苷酸变异(SNV)、小片段插 入/缺失(indel)、融合基因、拷贝数变异(CNA) 15, 16 。 如今,许多 FDA 批准的商业化肿瘤检测产品(包括实体瘤、 血液肿瘤和液体活检相关应用)都基于 tNGS 技术(表 2)。 tNGS主要采用两种富集策略:扩增子法(ampliconbased) 或杂交捕获法(hybrid-capture)。扩增子法基于qPCR扩 增,流程快速、成本较低,适合设计小型、聚焦面板,但 在检测结构变异及复杂区域方面灵敏度较低 17 。 杂交捕获
法可实现更均一的覆盖率,对结构变异(如基因融合、拷贝 数改变)及微卫星不稳定性(MSI)具有更优的检测能力, 但需要更高的DNA起始量与更长的流程时间 18 。 从产品开发角度来看,tNGS 面板具备良好的可扩展性,可 根据新兴生物标志物的发现灵活升级。这一特性使其特别 适合用于肿瘤分型、靶向治疗选择、和MRD监测等临床场 景。不过,tNGS 的实施仍面临一些挑战,如对高质量生物 信息学支持的依赖,样本质量不佳时的技术局限,相对较长 的检测周期,尤其是在资源有限或分散式检测环境中 14, 19 。 尽管如此,tNGS 在基因组覆盖范围、分析深度与临床可行 性之间达成了良好平衡,是当前精准肿瘤学中兼顾性能与 灵活性的核心技术平台。
表 2. 经FDA批准并应用于临床实践的靶向NGS检测实例
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