Lyo-Ready Genotyping Direct DNA qPCR FFPE-CN

PDGFRA1 基因突变

A)

B)

C)

A/A

G/A

G/G

RFU for Allele 1 - FAM

RFU for Allele 1 - FAM

RFU for Allele 1 - FAM

取健康FFPE肺组织 (野生型)和含有PDGFRA1突变的肺肿瘤FFPE组织 (突变型) 混合在一起,使用MDX168 提取缓冲液进行消解处理,然后从消解的粗裂解样本中去5.2ng DNA用于 qPCR扩增。纯合子等位基因G ( 红色 ),等位基因A ( 蓝色 ),杂合子等位基因G/A ( 绿色 ),NTC ( 黑色 )和x表示未知。

ATM 基因突变

A)

B)

C)

T/T

C/T

C/C

RFU for Allele 1 - FAM

RFU for Allele 1 - FAM

RFU for Allele 1 - FAM

取健康FFPE肺组织 (野生型)和含有ATM17 突变的肺肿瘤FFPE组织 (突变型) 混合在一起,使用MDX168 提取缓冲液进行消解处理,然后从消解的粗裂解样本中去5.2ng DNA用于 qPCR扩增。纯合子等位基因C ( 红色 ),等位基因T ( 蓝色 ),杂合子等位基因C/T ( 绿色 ),NTC ( 黑色 )和x表示未知。

FFPE组织粗提取 DNA vs FFPE 提纯DNA – PDGFRA1 检测

A)

B)

C)

MDX168

KAPA Probe Force qPCR Mix

TaqPath ProAmp Multiplex Master Mix

A/A

G/A

G/G

RFU for Allele 1 - FAM

RFU for Allele 1 - FAM

RFU for Allele 1 - FAM

A/使用MDX168提取缓冲液处理含有从肿瘤血管生成相关的PDGFRA1突变肺肿瘤FFPE组织 (突变型),然后取1.3 ng DNA直接进行qPCR检测; 或Qiagen QIAamp DNA FFPE 组织提取试剂盒对等量的突变型FFPE组织进行DNA提取,然后分别使用B/ KAPA Probe Force qPCR Mix (Roche)和C/ TaqPath ProAmp Multiplex Master Mix (ThermoFisher) 对1.3ng 提纯的DNA进行qPCR检测。纯合子等位基因G ( 红色 ),等位基因A ( 蓝色 ),杂合子等位基因G/A ( 绿色 ),NTC ( 黑色 )和x表示未知。结果显示,与对提纯的DNA检测相 比,Lyo-Ready TM 可冻干基因分型FFPE直扩qPCR预混液 (MDX168)对FFPE组织粗提取物的检测具有更强的等位基因识别和更紧密的簇集。

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