Meridian Lyo-Ready Genotyping Direct DNA qPCR Stool - CN

可冻干基因分型粪便 直扩qPCR预混液 实现从粪便样本中灵敏检测 SNPs. Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩qPCR预混液是无甘油的单管配方,专为粪便样本SNP基 因分型检测使用的双标签探针体系而优化,可用于检测遗传变异,如单核苷酸变异(SNPs)和 拷贝数变异。它适用于多种运用,包括传染病检测、癌症生物标记物检测、微生物组分析、抗 生素耐药性和药物基因组学。

Lyo-Ready TM Genotyping Direct DNA qPCR Stool

实现从粪便样本中灵敏检测 SNPs 可冻干基因分型粪便 直扩qPCR预混液

Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩qPCR预混液是无甘油的单管配方,专为粪便样本SNP基 因分型检测使用的双标签探针体系而优化,可用于检测遗传变异,如单核苷酸变异(SNPs)和 拷贝数变异。它适用于多种运用,包括传染病检测、癌症生物标记物检测、微生物组分析、抗 生素耐药性和药物基因组学。 基因分型检测可用于遗传疾病诊断,识别疾病风险因素,并指导治疗决策。单点突变,例如单核苷酸多态性(SNPs),是人类基因组中最常见的 遗传变异类型,在个体遗传多样性方面、增加或减少个体罹患癌症等疾病的风险方面发挥着重要作用。这些单点突变还对肠道内的微生物组产生 重大影响,可影响疾病的严重性,并改变治疗疾病的方式。 针对粪便样本的基因分型检测具有相当的挑战性,因为与血液或唾液等其他生物样本相比,粪便中通常含有较低浓度的DNA。此外,粪便中含有 的抑制物,以及对检测灵敏度的要求,都有可能会影响基因分型检测的成功率。

基因分型技术的进步提高了粪便检测的性能,为多个疾病领域的粪便检测开辟了途径,包括: 1. 传染病检测: 胃肠道感染,如产生类似志贺毒素的 大肠杆菌 ,或对 幽门螺杆菌 的抗生素耐药性 2.  癌症标志物检测: 肠癌等癌症的早期筛查 3. 药物基因组学: 确定影响个人对某些药物反应的基因变异 4. 流行病学研究: 用于群体遗传学研究,以深入了解各种特征或疾病的遗 传基础

产品亮点

•  超灵敏、可直接检测低至单个拷贝靶标 •  对粪便样本中的抑制物(如胆盐)和运输保存液 (如Cary-Blair培养基)中的抑制物具有超强耐受性 •  形成紧密的荧光簇,可清晰地区分等位基因,非常适合 困难的SNP •  可用于液体体系或冻干使用,是高通量或POC检测的理 想选择 •  可兼容不同冻干程序

迈迪安推出了全新的Lyo-Ready ™ 可冻干基因分型粪便直扩qPCR预混液可 实现快速、可靠、卓越的集群分辨和清晰的等位基因区分。其先进的配方 能够从粪便样本中超灵敏地扩增SNPs和其他位点突变,并且对样本中可能 破坏DNA和抑制PCR反应的胆盐具有超强耐受性。此外,该试剂既能用于 液体体系也能通过冻干用于开发常温稳定的检测,是用于POC设备的理想 选择。

产品

产品编号 产品体积 反应数

5 mL 1,000 个反应

Lyo-Ready Genotyping Direct DNA qPCR Stool,4x

MDX148

50 mL 10,000 个反应

www.meridianbioscience.com/lifescience

性能数据

Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩qPCR预混液结合了先进的化学缓冲液配方、PCR增强剂和优化的抗体热启动聚合酶,可以直接在粪便样 本(或运输保存液)存在PCR抑制物的情况下,实现快速、精确并且可重复的SNP检测,获得卓越的等位基因鉴别和集群分布。

对15 mg/mL人体粪便样本中结直肠癌相关BRAF V600E基因突变的灵敏检测

A)

B)

迈迪安MDX148

KAPA

分别使用 A)Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩 qPCR预混液(MDX148),B/ KAPA Probe Force qPCR Mix(Roche),C)TaqPath™ ProAmp™ Multiplex Master Mix(ThermoFisher)和 D)Type-it Fast SNP Probe PCR Kits(Qiagen)对15 mg/mL人体粪便样本 中的结直肠癌相关的BRAF V600E 突变(SNP 编 号:rs113488022)进行检测。BRAF V600E突变(VAL 600-GLU)是侵袭性肿瘤生长和表皮生长因子受体抑制 剂治疗的预后和预测性生物标志物。建议四期转移性结 直肠癌(mCRC)患者在开始使用抗表皮生长因子受体 抑制剂治疗前或化疗无效时进行 BRAF 检测1。结果显 示,与对比试剂相比,Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪 便直扩qPCR预混液对粪便样本直接检测低水平临床相 关的突变具有更高的灵敏度。

突变型扩增

野生型

C)

D)

TaqPath

Type-it

对20 mg/mL人体粪便样本中结直肠癌相关p53基因突变的灵敏检测

A)

B)

分别使用 A)Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩 qPCR预混液(MDX148),B/ KAPA Probe Force qPCR Mix(Roche),C)TaqPath™ ProAmp™ Multiplex Master Mix(ThermoFisher)和 D)Type-it Fast SNP Probe PCR Kits(Qiagen)对 20 mg/mL人体粪便样 本中结直肠癌相关 p53突变(SNP 编号:rs1042522) 进行检测。等位基因G( 蓝色 )和等位基因C( 红色 ) 的纯合样本,等位基因C/G的杂合样本( 绿色 ),与 NTC( 黑色 )进行比对,图中x表示未确定。约有一半 的结直肠癌患者具有p53 基因突变,对晚期胃癌进行紫 杉醇和顺铂联合化疗治疗显示,rs1042522(G/G)和 (C/G)基因型与病情恶化相关2。结果显示,与对比 试剂相比,Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩 qPCR预混液对粪便样本的直接检测具有更紧密的集群 分布,对临床相关的突变位点具有更准确的分辨。

C)

D)

等位基因 G | 等位基因 C | 等位基因 C/G | NTC

对3.33mg/mL人体粪便样本中克拉霉素耐药性相关的 幽门螺杆菌 检测

B)

A)

分别使用 A)Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩 qPCR预混液(MDX148),B/ KAPA Probe Force qPCR Mix(Roche),C)TaqPath™ ProAmp™ Multiplex Master Mix(ThermoFisher)和 D)Type-it Fast SNP Probe PCR Kits(Qiagen)对3.33 mg/mL人体粪便样 本中克拉霉素耐药性相关的 幽门螺旋杆菌 23s rRNA 基 因 A2143G 突变进行检测。 幽门螺杆菌 治疗采用克拉霉 素三联疗法,但克拉霉素耐药率的上升导致治疗失败率 居高不下。据观察,克拉霉素耐药性最常见的原因是 23S 核糖体 RNA 基因中的 A2143G 变异3。结果显示, 与对比试剂相比,Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直 扩qPCR预混液能够直接从粪便样本中检测出低水平的 23S 核糖体 RNA 基因,使其成为一种理想的快速检测 方法,可替代费时费力的培养方法。

Mutant amplification

WT

D)

C)

对10mg/mL人体粪便样本中产生志贺毒素的 大肠杆菌 株 uidA 基因突变检测

B)

A)

分别使用 A)Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩 qPCR预混液(MDX148),B/ KAPA Probe Force qPCR Mix(Roche),C)TaqPath™ ProAmp™ Multiplex Master Mix(ThermoFisher)和 D)Type-it Fast SNP Probe PCR Kits(Qiagen)对 10 mg/mL人体粪便样本 中产志贺毒素 大肠杆菌 (STEC)菌株的uidA 基因突变 进行检测。等位基因G( 蓝色 )和等位基因T( 红色 )的 纯合样本,等位基因T/G的杂合样本( 绿色 ),与 NTC( 黑色 )进行比对,图中x表示未确定。O157:H7 STEC 血清型与人类的严重疾病甚至死亡有关。O157 :H7菌株中存在一个高度保守的标记是uidA基因的924 位有一个G残基(而不是野生型 大肠杆菌 中的T残基)。 这种突变很难检测,但检测结果显示 Lyo-Ready™ 可冻 干基因分型粪便直扩qPCR预混液能直接从粪便样本中检 测出低水平的 23S 核糖体 RNA 基因,是一种理想的快 速替代方法。

D)

C)

等位基因 G | 等位基因 C | 等位基因 C/G | NTC

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对15 mg/mL人体粪便样本中高拷贝或低拷贝的DNA靶标具检测有超强的灵敏度和可重复性

使用Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩qPCR预混 液对15 mg/mL 人体粪便样本中10倍连续稀释的合成 DNA进行qPCR检测(分别为10000、1000、100、10 和1个拷贝),并且与KAPA Probe Force qPCR Mix( 绿 色 ),TaqPath™ ProAmp™ Multiplex Master Mix( 黑 色 )和Type-it Fast SNP Probe PCR( 蓝绿色 )进行对 比。结果显示,Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩 qPCR预混液在有PCR抑制物存在时,对低拷贝和高拷贝 DNA模板的检测依然具有更高的灵敏度和可重现性。

冻干后可常温保存18个月以上

A)

B)

Lyo-Ready™ 可冻干基因分型粪便直扩qPCR预混液冻干后在37°C下保存1个月后( 红色 )进行稳定性检测,将其复溶后与新鲜配置的液体体系( 蓝色 )进行对比,分别对 A) 提纯的DNA靶标;和 B)10mg/mL 人体粪便样本直接检测。冻干后的试剂与新鲜液体体系具有相同性能,以及相同的等位基因分辨能力。结果显示,Lyo-Ready™ 可冻干基 因分型粪便直扩qPCR预混液冻干后常温下储存稳定性超过18个月以上。 1. N CCN clinical cancer practice guideline in oncology (NCCN Guidelines) Ver.4-June 15, 2020 http://nccn.org/professionals/physician_gls/pdf/colon.pdf 2. Kim, J.G., et al. TP53 codon 72 polymorphism associated with prognosis in patients with advanced gastric cancer treated with paclitaxel and cisplatin. Cancer Chemother Pharmacol . 2009 Jul;64(2):355-60. doi: 10.1007/s00280-008-0879-3 3. Shen, J., et al. Formation of A2143G mutation of 23S rRNA in progression of clarithromycin-resistance in Helicobacter pylori 26695. Microb Drug Resist . 2005, 11: 100-106. 10.1089/mdr.2005.11.100. 4. Cebula, T.A., et al. Simultaneous Identification of Strains of Escherichia coli Serotype O157:H7 and Their Shiga-Like Toxin Type by Mismatch Amplification Mutation Assay-Multiplex PCR. J. Clin. Microbiol. , Jan. 1995, p. 248–250

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