Meridian Lyo-Ready Genotyping Direct DNA qPCR Urine - CN

可冻干基因分型尿液 直扩qPCR预混液 Lyo-ReadyTM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液是专为尿液样本SNP基因分型检测的双标 签探针体系优化的无甘油单管配方,可用于检测遗传变异,如单核苷酸变异(SNPs)和拷贝 数变异,是传染病检测、癌症标志物检测、无创产前检测和药物基因组学的理想选择。

可冻干基因分型尿液 直扩qPCR预混液 Lyo-Ready TM Genotyping Direct DNA qPCR Urine 可直接对尿液样本进行灵敏的SNP检测

Lyo-Ready TM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液是专为尿液样本SNP基因分型检测的双标 签探针体系优化的无甘油单管配方,可用于检测遗传变异,如单核苷酸变异(SNPs)和拷贝 数变异,是传染病检测、癌症标志物检测、无创产前检测和药物基因组学的理想选择。

基因分型检测可用于遗传疾病诊断,识别疾病风险因素,并指导治疗决策。单点突变,例如单核苷酸多态性(SNPs),是人类基因组中最常见的遗 传变异类型,在个体遗传多样性方面发挥着重要作用。虽然并非所有的单点突变都会产生功能性后果,但有些突变会显著影响基因功能或蛋白质结 构,这反过来会增加/降低个体患癌症等疾病的风险。 针对尿液样本的基因分型检测可能具有挑战性,因为与血液或唾液等其他生物样本相比,尿液通常含有较低浓度的DNA。此外,尿液中含有的抑制 物,以及对检测灵敏度的要求,都有可能会影响基因分型检测的成功率。随着基因分型技术的进步,从尿液样本中提取DNA并对其检测分析已可以 用于各种诊断应用,包括:

1.  传染病检测: 例如性传染病,包括HPV分型检测,和尿道感染等 2.  癌症标志物检测: 用于诸如膀胱癌等癌症早期检测 3.  无创产前检测 (NIPT): 从孕妇尿液中的无细胞胎儿DNA筛查胎儿 遗传性异常 4.  药物基因组学: 识别影响个体对某些药物反应的基因变异 5.  流行病学研究: 用于群体遗传学研究,以深入了解各种特征或疾病的 遗传基础 迈迪安推出了全新的Lyo-Ready TM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液可 实现快速、可靠、卓越的集群分辨和清晰的等位基因区分。其先进的配方能 够从尿液样本中超灵敏地扩增SNPs和其他位点突变,并且对样本中可能破 坏DNA和抑制PCR反应的尿素和核酸酶具有超强耐受性。此外,该试剂既能 用于液体体系也能通过冻干用于开发常温稳定的检测,是用于POC设备的理 想选择。

产品亮点

• 超灵敏、可直接检测低至单个拷贝靶标 • 对尿液样本中的抑制物(如尿素、核酸酶)和运输保存 液中的抑制物(如阴道拭子的UTM)具有超强耐受性 • 紧密的荧光簇,可清晰地区分等位基因,非常适合困难 的SNP • 可用于液体体系或冻干使用,是高通量或POC检测的理想 选择 • 可兼容不同冻干程序

产品

产品编号 体积 反应数

5 mL 1,000 个反应

Lyo-Ready Genotyping Direct DNA qPCR Urine, 4x

MDX158

50 mL 10,000 个反应

www.meridianbioscience.com/lifescience

性能数据

Lyo-Ready TM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液结合了先进的化学缓冲液配方、PCR增强剂和优化的抗体热启动聚合酶,可以直接在尿液样 本(或运输保存液)存在PCR抑制物的情况下,实现快速、精确并且可重复的SNP检测,获得卓越的等位基因鉴别和集群分布。

对40%通用运输保存液(UTM)中HPV -16型的突变检测

A)

B)

分别使用 A) Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩 qPCR预混液 (MDX158), B/ KAPA Probe Force qPCR Mix (Roche), C) TaqPath™ ProAmp™ Multiplex Master Mix (ThermoFisher) 和 D) Type-it Fast SNP Probe PCR Kits (Qiagen) 对40% UTM样本中的人乳头瘤病毒 (HPV)16型 E6-T350G突变进行检测。等位基因G( 蓝 色 )和等位基因T( 红色 )的纯合样本,等位基因G/T的 杂合样本( 绿色 ),与NTC( 黑色 )进行比对,图中x表 示未确定。HPV 16 的E6-T350G突变可能与宫颈癌和口 咽癌细胞的增殖有关 1 。结果显示,与对比试剂相比, Lyo-Ready TM 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液对 UTM样本的直接检测具有更紧密的集群分布,对临床相 关的突变位点具有更准确的分辨。

C)

D)

等位基因 G | 等位基因 T | 等位基因 G/T | NTC

对10%人体尿液中胰腺癌相关的KRAS-G12D突变检测

A)

B)

分别使用 A) Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩 qPCR预混液, B/ Kapa Probe Force, C/ TaqPath™ 和 D/ Type-it Fast Kits对10%人体尿液样本中胰腺癌癌症 细胞系SU.86.86的胰腺癌相关的KRAS-G12D 突变 DNA(SNP编码:rs121913529) 进行检测。等位基因 A( 蓝色 )和等位基因G( 红色 )的纯合样本,等位基 因A/G的杂合样本( 绿色 ),与NTC( 黑色 )进行比 对,图中x表示未确定。约35%的胰腺癌患者体内发现 了KRAS-G12D突变。通过小鼠实验研究已经确定了一 种有效的实验药物,该药物可以直接靶向作用于具有 这种突变的胰腺肿瘤 2 。结果显示,与对比试剂相比, Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液对 人体尿液样本中癌症相关的SNPs具有更准确的鉴别。

C)

D)

等位基因 A | 等位基因 G | 等位基因 A/G | NTC

对20%人体尿液样本中宫颈癌相关的p53突变检测

B)

A)

分别使用 A) Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩 qPCR预混液, B/ Kapa Probe Force, C/ TaqPath™ 和 D/ Type-it Fast Kits对20%人体尿液样本中宫颈癌相关 的p53突变(SNP编码:rs1042522) 进行检测。等位基 因G( 蓝色 )和 等位基因C( 红色 )的纯合样本,等位 基因C/G的杂合样本( 绿色 ),与NTC( 黑色 )进行比 对,图中x表示未确定。Meta分析显示p53 rs1042522 C>G 突变可增加宫颈癌风险 3 。结果显示,与对比试剂 相比,Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预 混液对20%尿液样本中的p53突变具有更准确的等位基 因分辨。

D)

C)

等位基因 G | 等位基因 T | 等位基因 G/T | NTC

对30%人体尿液样本中膀胱癌相关的PAI1突变检测

B)

A)

分别使用 A) Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩 qPCR预混液, B/ Kapa Probe Force, C/ TaqPath™ 和 D/ Type-it Fast Kits对30%人体尿液样本中膀胱癌相 关的PAI1突变(SNP编码:rs7242) 进行检测。等位基 因G( 蓝色 )和等位基因T( 红色 )的纯合样本,等位 基因G/T的杂合样本( 绿色 ),与NTC( 黑色 )进行比 对,图中x表示未确定。膀胱癌是最常见的癌症之一, 具有较高的复发率。最近的研究表明SNP rs7242使纤 溶酶原激活物抑制剂-1(PAI1)的抗凋亡作用升高, 导致更高的膀胱癌复发风险 4 。结果显示,与对比试剂 相比,Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预 混液对30%尿液样本中的PAI1突变具有更准确的等位 基因分辨。

D)

C)

等位基因 G | 等位基因 T | 等位基因 G/T | NTC

www.meridianbioscience.com/lifescience

对10%尿液中低拷贝的DNA靶标具有超强的灵敏度和可重复性

使用Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混 液对10%人体尿液样本中10倍连续稀释的合成DNA进行 qPCR检测(分别为10000、1000、100、10和1个拷 贝)。结果显示,Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直 扩qPCR预混液在有PCR抑制物存在时,对低拷贝和高拷 贝DNA模板的检测依然具有超高的灵敏度和可重现性。

1,000 个拷贝 100 个拷贝 10,000 个拷贝

10 个拷贝 1 个拷贝

冻干后可常温保存12个月以上

A)

纯合型 A/A 扩增曲线

杂合型 C/A 扩增曲线

纯合型 C/C 扩增曲线

等位基因 A | 等位基因 C

B)

等位基因分辨

Lyo-Ready™ 可冻干基因分型尿液直扩qPCR预混液冻干后在37°C下保存1个月后( 红色 )进行稳定性检测,将其 复溶后与新鲜配置的液体体系( 蓝色 )进行对比,对10%人体尿液血进行直接检测。冻干后的试剂与新鲜液体体系 具有A) 相同性能,以及B)相同的等位基因分辨能力(等位基因AA( 红色 )和等位基因CC( 蓝色 )为纯合样本,等 位基因A/C为杂合样本( 绿色 ),与NTC( 黑色 )进行比对,图中x表示未确定)。结果显示,Lyo-Ready™ 可冻 干基因分型尿液直扩qPCR预混液冻干后常温下储存稳定性超过18个月以上。

1. Kottaridi, C., et al. The T350G Variation of Human Papillomavirus 16 E6 Gene Prevails in Oropharyngeal Cancer from a Small Cohort of Greek Patients. Viruses 2022 14:1724. doi: 10.3390/v14081724 2. Kemp, S.B., et al. Efficacy of a Small-Molecule Inhibitor of KrasG12D in Immunocompetent Models of Pancreatic Cancer. Cancer Discov . 2023 13(2):298-311. doi: 10.1158/2159-8290.CD-22-1066. 3. Yu M., et al. Associations of MDM2 rs2279744 and TP53 rs1042522 polymorphisms with cervical cancer risk: A meta-analysis and systematic review. Front Oncol , 2022 12, 973077. doi: 10.3389/fonc.2022.973077. 4. Murakami K., et al. Association of SNPs in the PAI1 Gene with Disease Recurrence and Clinical Outcome in Bladder Cancer. Int J Mol Sci . 2023 24(5):4943. doi: 10.3390/ijms24054943.

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